Tema je stara skoro mesec dana ali ajde da odgovorim..
Ovako: prvo, koja je verzija MS SQL servera u pitanju.
Skini obican jdbcsql driver (isti je i za 2005 i za 2008).
Ono sto mislim da tebi pravi problem je konekcija, tj zatvoren je tcp/ip protocol. Njega treba da otvoris i da pogledas koji je port u pitanju. Po defaultu bi trebalo da je 1433 ali ne mora da znaci.
Da li si na serveru (bazi) kreirao usera i dao mu odredjena ovlascenja? To treba da odradis, ako vec nisi.
Najbolje bi bilo da postavis kod koji si napisao za konekciju i gresku koju ti baca pa da vidimo sta je u pitanju..
takodje, pogledaj ovu temu
kako se iz jave konektovati na sql server 2008
ovde pise dosta o tome