Mislim da ti je problem sa Master Boot Record-om.
I ja sam imao slicnih problema, samo sto nisam stalno menjao BIOS opcije,
BIOS generalno nije pravljen da bi se svaki cas cackalo.
Hard Disk Boot Priority opcijom u BIOS-u podesavas koji ce ti od vise hard diskova biti prvi, c:, i u njega se upisuje MBR pa kada to promenis on ne moze da nadje MBR zapis (mislim da je tako nisam siguran)
Ako nesto menjas oko particija najbolje je da to radis iz OS koji je na C: koji ti je stalan
Hedonista na kvadrat!